La Ernst-Haeckel-Haus de Jena es un museo dedicado a la vida y obra de Ernst Haeckel, famoso zoólogo, filósofo y darwinista. El museo forma parte de la Universidad Friedrich-Schiller de Jena y está ubicado en la antigua residencia de Haeckel. Sirve de homenaje a las importantes contribuciones de Haeckel al campo de la zoología y a su influencia en el darwinismo.
La Ernst-Haeckel-Haus se encuentra en la antigua residencia de Haeckel, la "Villa Medusa" de dos plantas. El museo alberga una colección de manuscritos originales, libros, cartas, dibujos, retratos, fotografías y grabados relacionados con la vida y obra de Haeckel. Estas exposiciones ofrecen una visión completa de la vida científica y personal de Haeckel.
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